御祭神は、神功皇后が新羅へ向かう時、和魂は皇后の身体を守り、荒魂は船団を導き、渡海を守護された神であり、航海安全の神として信仰される。社地は縁起によれば、伊弉諾尊が黄泉の国（よみのくに）からもどり、禊（みそぎ）をし、三神が化生せられた場所とされている。
日本全国に約二千余社ある住吉三神を祀る神社の中でも
古い神社とされ、古来「住吉本社」「日本第一住吉宮」と称えられる。神功皇居の御儀以来、朝野の信仰著しく、時代と共に天皇よりの奉幣があったことが史書に記される。また諸武将の崇敬も篤く、楠木正成、源頼朝、足利尊氏などは祈願文や寄進状を寄せている。『延喜式』では名神大社となり、その後筑前国一の宮として、神仏習合の社として栄えた。本殿は、元和9年（1623）黒田長政が再建したもので、仏教渡来前の古代建築様式を伝える「住吉造」として、国の重要文化財である。