棚倉町の近く、白河市表郷三森に都都古山があり、別名建鉾山とよばれているが、景行天皇の御代、日本武尊が東征を行う際に、この山に鉾を建て、奥州の地主神である味耜高彦根命を祀ったのが創祀と伝わる。また、大同2年（807）、坂上田村麿が東征の際、現在の棚倉城跡の伊野荘に遷し、社殿を造営し日本武尊を併せ祀ったとある。
そして、寛永元年（1624）に棚倉藩主丹羽長重が同城を築城する為に、城の北西にある段丘上の現在地に神社を遷座した。
古来、坂上田村麿をはじめ、奥州に関わり深い武将・結城氏・佐竹氏また秀吉・家康等の信仰篤く、社殿の造営や神領の寄進を受けている。中世以降近津上ノ宮といわれ、近津三所明神と称し、水戸徳川家が崇敬し、代々の先規により神領朱印状を贈った。
境内には樹齢数百年の古木が茂り、棚倉城地より解体移築されたと伝えられる流造の本殿や、向拝一間に唐破風を持つ拝殿は荘厳である。